Должностные лица Статкомитета СНГ пользуются иммунитетом от личного задержания или ареста, от административной и судебной юрисдикции Российской Федерации в отношении действий, совершенных ими при исполнении служебных обязанностей.
Председатель Статкомитета СНГ и его заместители не только имеют право, но и обязаны отказаться от иммунитета, предоставленного должностному лицу Статкомитета СНГ, в тех случаях, когда, по их мнению, такой иммунитет препятствует отправлению правосудия и от него можно отказаться без ущерба для интересов Статкомитета СНГ.
Статкомитет СНГ постоянно сотрудничает с соответствующими властями для предупреждения каких-либо злоупотреблений со стороны служащих аппарата Статкомитета СНГ в связи с предоставленными им привилегиями и иммунитетами.