Управление воинскими межгосударственными перевозками осуществляется на всех видах транспорта следующими органами управления:
на территории Российской Федерации - Центральным управлением военных сообщений Министерства обороны Российской Федерации;
на территории Кыргызской Республики - Службой военных сообщений управления тыла Министерства обороны Кыргызской Республики.
Ежесуточно два раза по состоянию на 6.00 и 18.00 московского времени отчетных суток Центральное управление военных сообщений Министерства обороны Российской Федерации и Служба военных сообщений управления тыла Министерства обороны Кыргызской Республики обмениваются информацией о состоянии дел с перевозками воинских формирований и воинских грузов и, при необходимости, принимают по ним решения в рамках своей компетенции.