Пограничное управление ведет оперативно-разыскную деятельность в интересах охраны государственной границы. Порядок ее ведения определяется отдельным соглашением.
Пограничное управление во взаимодействии с полномочным органом Абхазской Стороны и другими ее правоохранительными органами ведет дознание по делам о нарушении государственной границы и производит неотложные следственные действия в соответствии с уголовным и уголовно-процессуальным законодательством Республики Абхазия.
Пограничное управление во взаимодействии с полномочным органом Абхазской Стороны и ее другими правоохранительными органами осуществляет производство по делам об административных правонарушениях в области защиты государственной границы в соответствии с административным и административно-процессуальным законодательством Республики Абхазия.
