Совет организуется таким образом, чтобы он мог функционировать непрерывно. Для этой цели каждая Сторона должна быть постоянно представлена в месте пребывания АНЦ. Стороны в соответствии с национальным законодательством назначают своих постоянных представителей при АНЦ.
Положение о постоянном представителе государства - члена Шанхайской организации сотрудничества при Антинаркотическом центре Шанхайской организации сотрудничества утверждается Советом глав государств - членов ШОС.
Совет периодически собирается на заседания, на которых каждая Сторона может быть представлена руководителем компетентного органа Стороны или другим специально уполномоченным представителем.
Совет определяет порядок осуществления основных задач и функций АНЦ, указанных в статье 6 настоящего Соглашения.
Совет представляет ежегодные доклады о деятельности АНЦ Совету глав государств - членов ШОС.
Решение в Совете по любому вопросу считается принятым, если ни одна из Сторон не возразила против него (консенсус).
Совет устанавливает свои правила процедуры, включая порядок избрания своего председателя.