Универсальный центр осуществляет свою текущую деятельность во взаимодействии с другими постоянно действующими органами ШОС.
Взаимодействие Универсального центра с Секретариатом ШОС регламентируется Положением.
Взаимодействие Универсального центра с Антинаркотическим центром ШОС регулируется отдельным соглашением между Сторонами.