Российский центр науки и культуры в г. Любляне осуществляет свою деятельность под общим руководством главы дипломатического представительства Российской Федерации в Республике Словении.
Функционирование Российского центра науки и культуры в г. Любляне обеспечивается Федеральным агентством по делам Содружества Независимых Государств, соотечественников, проживающих за рубежом, и по международному гуманитарному сотрудничеству.
Словенский центр науки и культуры в г. Москве осуществляет свою деятельность под покровительством главы дипломатического представительства Республики Словении в Российской Федерации.