Уполномоченные органы государств Сторон ежегодно определяют размер субсидий на текущий финансовый год и плановый период, предоставляемых Университету из бюджетов Российской Федерации и Республики Армения.
Университет может принимать участие в выполнении научных и научно-технических программ и проектов, реализуемых в Российской Федерации за счет бюджетных ассигнований федерального бюджета и в Республике Армения за счет средств государственного бюджета Республики Армения, а также за счет средств различных гуманитарных и научных фондов государств Сторон, зарубежных стран, международных организаций и фондов.