Российский центр науки и культуры в г. Вифлееме осуществляет свою деятельность под общим руководством главы дипломатического представительства Российской Федерации в Палестинской национальной администрации.
Функционирование Российского центра науки и культуры в г. Вифлееме обеспечивается Федеральным агентством по делам Содружества Независимых Государств, соотечественников, проживающих за рубежом, и по международному гуманитарному сотрудничеству.