Управление воинскими межгосударственными перевозками осуществляется на территории Российской Федерации во взаимодействии с Центральным управлением военных сообщений Министерства обороны Российской Федерации и Управлением специальных перевозок Министерства внутренних дел Российской Федерации, а на территории Украины - с Центральным управлением военных сообщений Тыла Вооруженных Сил Украины и Управлением специальных перевозок Министерства внутренних дел Украины.
Центральное управление военных сообщений Министерства обороны Российской Федерации и Управление специальных перевозок Министерства внутренних дел Российской Федерации ежесуточно по состоянию на 6.00 и 18.00 московского времени отчетных суток обмениваются соответственно с Центральным управлением военных сообщений Тыла Вооруженных Сил Украины и Управлением специальных перевозок Министерства внутренних дел Украины информацией о положении дел с воинскими межгосударственными перевозками и при необходимости принимают решения в рамках своей компетенции.
